吉田松陰は安政の大獄により３０歳で処刑され、小塚原に葬られたが、松下村塾の門下生により密かに別の場所に移され、更に当時の毛利藩別邸のこの地に改葬された。

松陰神社へは三軒茶屋より東急世田谷線に乗り松陰神社前で降りて松陰神社商店街を進むと徒歩５，６分で到着する。

松陰神社には山口県萩の松陰神社に保存されている松下村塾と同じ作りの建物がある。